Protein–RNA interactions for Protein: O55128

Sap18, Histone deacetylase complex subunit SAP18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap18O55128 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sap18O55128 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sap18O55128 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sap18O55128 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sap18O55128 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sap18O55128 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sap18O55128 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sap18O55128 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sap18O55128 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sap18O55128 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sap18O55128 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sap18O55128 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sap18O55128 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sap18O55128 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sap18O55128 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sap18O55128 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sap18O55128 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sap18O55128 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sap18O55128 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms