Protein–RNA interactions for Protein: O43463

SUV39H1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUV39H1O43463 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SUV39H1O43463 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SUV39H1O43463 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SUV39H1O43463 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SUV39H1O43463 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SUV39H1O43463 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms