Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sp100O35892 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp100O35892 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp100O35892 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp100O35892 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp100O35892 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sp100O35892 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sp100O35892 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp100O35892 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp100O35892 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp100O35892 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp100O35892 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sp100O35892 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sp100O35892 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp100O35892 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sp100O35892 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp100O35892 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp100O35892 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp100O35892 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sp100O35892 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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