Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Efna3O08545 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna3O08545 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna3O08545 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Efna3O08545 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna3O08545 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna3O08545 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna3O08545 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna3O08545 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Efna3O08545 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Efna3O08545 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Efna3O08545 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna3O08545 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna3O08545 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Efna3O08545 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Efna3O08545 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna3O08545 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Efna3O08545 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna3O08545 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efna3O08545 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms