Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gm3415J3QMS8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Gm3415J3QMS8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gm3415J3QMS8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gm3415J3QMS8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gm3415J3QMS8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gm3415J3QMS8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gm3415J3QMS8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gm3415J3QMS8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms