Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gm20828J3KMI7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm20828J3KMI7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gm20828J3KMI7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20828J3KMI7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20828J3KMI7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20828J3KMI7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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