Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zkscan2G3X952 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zkscan2G3X952 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Zkscan2G3X952 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Zkscan2G3X952 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Zkscan2G3X952 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Zkscan2G3X952 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Zkscan2G3X952 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Zkscan2G3X952 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zkscan2G3X952 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zkscan2G3X952 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zkscan2G3X952 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zkscan2G3X952 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms