Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apol7aB2RT54 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apol7aB2RT54 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apol7aB2RT54 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apol7aB2RT54 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Apol7aB2RT54 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Apol7aB2RT54 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Apol7aB2RT54 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms