Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Slfn8B1ARD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slfn8B1ARD8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Slfn8B1ARD8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Slfn8B1ARD8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Slfn8B1ARD8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Slfn8B1ARD8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms