Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1V5

Vwa5b1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b1A9Z1V5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vwa5b1A9Z1V5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vwa5b1A9Z1V5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vwa5b1A9Z1V5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vwa5b1A9Z1V5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vwa5b1A9Z1V5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms