Protein–RNA interactions for Protein: A4UUI3

Gbp4, Guanylate binding protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4A4UUI3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gbp4A4UUI3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Gbp4A4UUI3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gbp4A4UUI3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gbp4A4UUI3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbp4A4UUI3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp4A4UUI3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms