Protein–RNA interactions for Protein: A2A884

Hivep3, Transcription factor HIVEP3, mousemouse

Predictions only

Length 2,348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep3A2A884 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hivep3A2A884 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hivep3A2A884 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hivep3A2A884 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hivep3A2A884 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hivep3A2A884 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms