Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MIR132-201ENST00000591554 101 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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SH3BP1Q9Y3L3 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SH3BP1Q9Y3L3 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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