Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC099520.2-201ENST00000523745 567 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
SHOC2Q9UQ13 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
SHOC2Q9UQ13 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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