Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC092683.1-207ENST00000620051 837 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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SH3BP4Q9P0V3 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AGO3-203ENST00000373191 19687 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
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