Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP31Q70CQ4 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP31Q70CQ4 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP31Q70CQ4 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP31Q70CQ4 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP31Q70CQ4 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP31Q70CQ4 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP31Q70CQ4 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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USP31Q70CQ4 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
USP31Q70CQ4 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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