Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
USF2Q15853 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
USF2Q15853 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
USF2Q15853 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
USF2Q15853 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
USF2Q15853 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
USF2Q15853 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
USF2Q15853 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 BCL11A-205ENST00000409351 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
USF2Q15853 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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