Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RNA5SP115-201ENST00000411160 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MCTP2-208ENST00000557742 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 CNTN1-204ENST00000547849 3125 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDCD1Q15116 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms