Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 AC079296.1-202ENST00000521394 960 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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CDH18Q13634 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CDH18Q13634 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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