Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
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TCIRG1Q13488 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RPL23AP18-201ENST00000416139 468 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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