Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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TCOF1Q13428 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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TCOF1Q13428 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCOF1Q13428 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCOF1Q13428 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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