Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SRSF5Q13243 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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