Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RPS4XP6-201ENST00000477670 797 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
GPS1Q13098 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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