Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC016994.1-201ENST00000425419 552 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 H3F3BP1-201ENST00000440551 403 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
FOXF2Q12947 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms