Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 BMS1-201ENST00000374518 7753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MRE11-201ENST00000323929 6897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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BPTFQ12830 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC009234.1-201ENST00000634985 895 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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BPTFQ12830 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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BPTFQ12830 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
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BPTFQ12830 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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BPTFQ12830 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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BPTFQ12830 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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BPTFQ12830 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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BPTFQ12830 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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BPTFQ12830 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CLIC5-201ENST00000185206 6023 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC073137.1-201ENST00000605636 634 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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