Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
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