Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL32P1-201ENST00000406301 247 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CAPN6Q9Y6Q1 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CAPN6Q9Y6Q1 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CAPN6Q9Y6Q1 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01205-201ENST00000489670 1331 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CAPN6Q9Y6Q1 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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