Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 SLC2A14-218ENST00000543909 4125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FRYL-210ENST00000507711 5277 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RN7SKP184-201ENST00000362348 333 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ELOCP28-201ENST00000590044 317 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC087516.2-201ENST00000558963 3042 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MTO1-202ENST00000370305 2174 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC013403.1-201ENST00000436954 263 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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