Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NR1H4-206ENST00000548884 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR52I1-202ENST00000530443 2961 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DNM1L-202ENST00000358214 3229 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 HCG18-239ENST00000454129 4433 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL590762.1-201ENST00000391782 432 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC063943.2-201ENST00000495697 534 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NXF2-202ENST00000625106 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CCL16-205ENST00000611905 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
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