Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 DNAJC28-202ENST00000381947 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL603962.1-201ENST00000413148 436 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SETP10-201ENST00000424368 814 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TAF1AQ15573 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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