Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SMARCE1P3-201ENST00000553649 1231 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AC006237.1-201ENST00000603816 480 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
SYCP1Q15431 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC068481.1-202ENST00000428379 555 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 FSIP2-AS1-202ENST00000436557 689 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
SYCP1Q15431 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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