Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
R3HDM1Q15032 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC093581.1-201ENST00000446411 461 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC062004.1-201ENST00000518706 686 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 OR4A40P-201ENST00000533878 948 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 ARMCX5-201ENST00000246174 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 OR4A2P-201ENST00000527276 913 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
R3HDM1Q15032 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms