Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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ITGA9Q13797 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
ITGA9Q13797 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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