Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
ACADSBP45954 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 HMGB1P32-201ENST00000425971 565 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms