Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
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HOXD10P28358 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
HOXD10P28358 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
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