Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008833.1-201ENST00000611633 691 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139022.1-201ENST00000556127 486 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NEDD8-MDP1E9PL57 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms