Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 OR8A1-201ENST00000284287 1146 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
USP18Q9UMW8 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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