Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPL5P25-201ENST00000441148 775 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL035446.1-201ENST00000455011 453 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 VN2R3P-201ENST00000422626 1412 ntBASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PWRN1-208ENST00000567647 561 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
USP35Q9P2H5 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
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