Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 FAM196A-202ENST00000522781 4403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ZNF410-224ENST00000615736 1551 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 CCR1-201ENST00000296140 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 XKRX-201ENST00000372956 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 PCDH15-223ENST00000495484 1896 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 CCDC162P-214ENST00000640755 1958 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 CACNA1D-201ENST00000288139 9341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 ZNF334-206ENST00000625284 2495 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 TTC3-202ENST00000355666 7712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 CTAGE15-201ENST00000420911 2587 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 CDC27-204ENST00000527547 2579 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 AC012651.1-204ENST00000495723 3881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CNKSR2Q8WXI2 TMEM231-201ENST00000258173 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 FRMPD2-201ENST00000305531 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 MIR4458HG-203ENST00000606459 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 CAMSAP2-203ENST00000413307 4498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 CCR4-201ENST00000330953 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 KBTBD4-201ENST00000395288 2460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 BPNT1-203ENST00000414869 2357 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC093768.1-201ENST00000505987 2173 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 TCF7L2-221ENST00000545257 2160 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC018647.1-202ENST00000449644 1651 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 HP1BP3-201ENST00000312239 3938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 GPATCH11-202ENST00000409774 3906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 MAP1LC3C-201ENST00000357246 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 GIP-201ENST00000357424 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RNU1-120P-201ENST00000363009 157 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 CST13P-201ENST00000376992 428 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AL109659.1-201ENST00000431986 651 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 LINC02022-201ENST00000448129 635 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL107P-201ENST00000478127 283 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL630P-201ENST00000483714 297 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RAB30-205ENST00000527633 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC018448.2-201ENST00000548295 305 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC020978.2-201ENST00000563203 428 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 uc_338.2-201ENST00000612963 182 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC243654.1-201ENST00000620218 293 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC025279.3-201ENST00000622398 104 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC079801.1-201ENST00000623753 388 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC097662.1-204ENST00000396588 2214 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 YPEL4-203ENST00000524669 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 CABYR-218ENST00000627314 1622 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 LINC02028-202ENST00000432154 2666 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 MAPK10-386ENST00000642038 2354 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 ABLIM1-203ENST00000369253 2255 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 MRPL19-202ENST00000393909 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 ADAMTS6-203ENST00000381055 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 PTAFR-202ENST00000373857 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 PLRG1-201ENST00000302078 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 CTNNA2-217ENST00000540488 2792 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 SP140-203ENST00000392045 3246 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 EPN1-202ENST00000270460 16219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RNA5SP74-201ENST00000363538 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 IGLV2-14-201ENST00000390312 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 PRELID1P2-201ENST00000407805 396 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 TMEM139-202ENST00000409102 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 RPL3P8-201ENST00000432928 1191 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 HIST1H2APS5-201ENST00000454320 369 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC009955.1-201ENST00000455896 271 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
CNKSR2Q8WXI2 AC239859.3-201ENST00000456469 408 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms