Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 LINC01903-201ENST00000580659 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 BRD7P1-201ENST00000557705 1915 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MAP3K7CL-209ENST00000399947 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AP002370.1-201ENST00000528055 1602 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 EIF4A2-205ENST00000440191 1889 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MIR4432HG-202ENST00000453476 703 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 OR8G5-202ENST00000641707 1156 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 NDUFA4-201ENST00000339600 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
NEDD1Q8NHV4 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms