Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MTND2P30-201ENST00000456663 382 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC02278-201ENST00000512170 500 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CCDC142Q17RM4 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC020661.4-201ENST00000561388 500 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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