Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PUM3Q15397 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SNX24-202ENST00000395451 1050 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC00601-201ENST00000456514 1168 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PUM3Q15397 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms