Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 NCK1-AS1-201ENST00000461864 1194 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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