Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 TIFA-202ENST00000500655 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RBBP4P1-201ENST00000502424 1276 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AK6-203ENST00000502819 743 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 LINC02565-201ENST00000592678 478 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC129778.1-202ENST00000623812 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AL591379.1-207ENST00000635982 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AMYH02020865.1-205ENST00000636189 261 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BNIP1Q12981 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BNIP1Q12981 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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