Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 CCDC58P3-201ENST00000590792 430 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 OR8B1P-202ENST00000641132 1178 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
EPHB4P54760 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
EPHB4P54760 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.3 ms