Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AL645927.2-201ENST00000618350 349 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
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PGGT1BP53609 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PGGT1BP53609 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PGGT1BP53609 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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