Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR5M12P-201ENST00000423388 929 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SH3BP1Q9Y3L3 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms