Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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TDP1Q9NUW8 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
TDP1Q9NUW8 LINC01527-201ENST00000419578 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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