Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 HDAC2-AS2-217ENST00000523087 493 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC243960.1-203ENST00000595395 599 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
NTRK2Q16620 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms