Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC005522.1-201ENST00000395416 346 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC013244.1-201ENST00000604279 193 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
RFTN1Q14699 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms